Η λειτουργία του Κοινωνικού Παντοπωλείου εντάσσεται στο δίκτυο πρωτοβουλιών και δράσεων των Δήμων της Σάμου για την κοινωνική προστασία και μέριμνα ευπαθών ομάδων του πληθυσμού που διαμένουν μόνιμα στο νησί και έχουν υποστεί μεγάλη μείωση του εισοδήματός τους, εξαιρίας διαφόρων παραγόντων.

Το Κοινωνικό Παντοπωλείο Σάμου συγχρηματοδοτείται από το Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο στα πλαίσια του Επιχειρησιακού Προγράμματος «Βόρειο Αιγαίο 2014-2020» και λειτουργεί διαδημοτικά, καλύπτοντας έτσι τις ανάγκες των κατοίκων των Δήμων Δυτικής και Ανατολικής Σάμου. Στελεχώνεται από έναν Κοινωνικό Λειτουργό και έναν Διοικητικό Υπάλληλο.

Διανέμει δωρεάν, σε άτομα και νοικοκυριά που το έχουν ανάγκη, τρόφιμα, είδη ατομικής υγιεινής, είδη ένδυσης και υπόδησης κλπ. Η λειτουργία του βασίζεται σε χορηγίες ιδιωτών, επιχειρήσεων και συλλόγων που είναι κοινωνικά ευαισθητοποιημένοι και επιθυμούν να συνδράμουν στην επίτευξη του παραπάνω στόχου.